Отвечаем на ваш вопрос:
Согласно законодательству Российской Федерации, при наличии брачного договора, права и обязанности супругов в отношении имущества могут быть определены иным образом, чем это предусмотрено законом.
В данном случае, если в брачном договоре было прописано, что все имущество, оформленное на мужа, является его собственностью, то по умолчанию при наследовании квартиры собственнику (сыну от другого брака) достанется она в полном объеме, а мужу — ничего.